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全基因组de novo测序也叫从头测序,是指不需要任何参考序列,用生物信息学分析方法的测得到的序列进行组装,从而获得该物种的全基因组序列图谱,为后续的基因挖掘、功能验证提供序列信息;为分子育种和合成生物学研究奠定基础。
使用Nanopore长序列(N50 达到30Kb,最长序列2Mb以上)组装后使用二代数据进行纠错,得到高质量的Contig(N50大于1Mb,部分可到10Mb以上)。结合HiC把组装的Contig挂载到染色体,获得染色体水平的全基因组序列图谱,注释后通过其他分析揭示研究的科学问题。

技术优势



 
研究策略

Nanopore (100×) + Illumina (或BGI-seq)(100×) + Hi-C(100×Illumina或BGI-seq)

分析内容
 

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