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泛基因组即某一群体全部基因的总称,包括核心、非必须基因组(部分样品中存在的基因),以及特有基因(仅在某一个样品中存在的基因)。核心基因组是所有样品中都存在的基因,反映物种稳定性,通常与物种生物学功能和主要表型相关;非必须基因和特有基因,一般反映物种特有的生物学特征以及对特定环境的适应性。
应用Nanopore测序和生物信息分析技术,对不同但又相互关联的个体材料进行较高深度测序和组装,构建泛基因组图谱,解码该物种完整的遗传信息。

基因组特征 单个个体低组装指标 高组装指标
简单基因 ONT(30-50×)+二代(50×) ONT(80-100×)+二代(100×)
高杂合高重复基因组 ONT(50-50-60×)+二代(60×) ONT(80-100×)+二代(100×)
超大高杂合高重复基因组 ONT(50-50-60×)+二代(60×) ONT(80-100×)+二代(100×)





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2020 大豆 Cell
2020 油菜 Nature Plants
2019 番茄 Nature genetics
2018 水稻 Nature Genetics
 
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