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全基因组关联分析(Genome wide association study, GWAS)是一种全基因组范围内,通过高密度单核苷酸多态性(SNP),利用连锁不平衡,挖掘影响表型性状基因的统计分析方法。针对已有参考基因组的物种群体,利用全基因组重测序能精准地得到全基因组大量的遗传信息,最大程度地挖掘出群体内的遗传变异,有助于对所研究物种典型性状的分子调控机制的研究,为分子育种、驯化改良提供重要的科学理论和实践应用价值。

优势

(1)全基因组水平、变异信息更全、密度更大;
(2)遗传变异类型丰富:单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)和拷贝数变异(CNV),深度解析基因变异的各个方面;
(3)分辨率高,最高可达到单碱基水平;
(3)精确定位与性状关联的候选基因或基因区域。

分析内容


 

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