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2020年 Nanopore 测序小班培训火热招募


一次培训学会从理论学习、样品提取到上机操作,再到数据预处理的全部内容。
资深讲师和经验丰富的实验员和分析人员面对面教学。
小班课程,4-6个人一组,一张测序芯片。每人自带样品,获得价值6000元的10G数据。
实战——没有套路
理论+实验+数据处理+数据
 
如果您对基因测序感兴趣,希望有机会自己做实验,自己做分析;
如果您想入手纳米孔测序仪,希望能找到能快速掌握实验技能和生物信息分析水平;
如果您在实验和分析过程中问题不断,想要掌握更多的操作经验。
那么赶紧报名吧!来参加贝纳基因举办的Nanopore测序实验操作和信息分析培训班,您将收获满满,不虚此行!
 

贝纳基因组对 Nanopore 测序的优化

宏因组DNA提取和测序流程优化=产出更多数据+更长
药用植物提取和测序流程优化=产出更多数据+更长
Direct RNA提取和测序流程优化

培训导师介绍

宋驰
博士,副研究员,中药数据中心副主任,武汉贝纳科技服务有限公司首席科学家。第一篇基于Nanopore测序技术组装的大型基因组菊花基因组文章的一作。
2012年毕业于中国科学院研究生院,取得博士学位。2010-2013年,就职于深圳华大基因研究院。多年来从事生物信息学、植物基因组学及药用植物转录组学研究。发表论文十余篇,其中以第一作者发表Nature Genetics文章1篇,第二作者发表Nature Biotechnology文章1篇,署名作者发表Nature Genetics文章3篇和Genome Biology文章1篇。

田朝阳
武汉贝纳科技服务有限公司生产总监,资深三代和四代测序工程师
2014年10月-2015年10月从事 PacBio 样品前处理和建库工作,2015年11月-2016年10月从事PacBio测序工作和研发工作。2016年11月-2018年6月,从事Nanopore测序样品前处理和Hi-C建库研发工作。2018年至今,任贝纳基因生产部总监。

牛妍
武汉贝纳科技服务有限公司项目总监,高级生物信息分析工程师。先后完成40多个基因组的组装、注释和分析工作。
 
主办单位:武汉贝纳科技服务有限公司
地点:武汉市洪山区光谷生物城C2-4栋5楼
时间:2019年11月30日-2019年12月2日
 
培训特色

您将得到技术专家的详细指导;
您将用自己的样品进行文库制备及上机操作,得到自己的10G数据;
您将对自己的数据亲自上机运行数据分析流程。
 

课程安排

时间 主题 课程内容
第一天上午 理论科普
宋驰
1、Nanopore测序技术原理及应用;
2、Nanopore与Pacbio技术优缺点、价格、市场占比、用户接受度、文章情况等介绍。
第一天下午 实验讲解
田朝阳
1、不同样品的送样标准(包括组织、核酸);
2、提取(我们的提取优化过程及成果);
3、建库(常规gDNA文库、+barcode文库、cDNA文库、direct RNA文库、扩增子文库等);
4、测序(3种仪器芯片、通量介绍)。
第二天 实验操作
田朝阳
1、建库(微生物加barcode建库);
2、MinION上机;
客户可自带1个样本,参与实操。
第三天上午 分析介绍
牛妍
1、Nanopore下机数据处理;
2、简单统计下机数据量N50、平均长度等指标,拆分barcode;
3、答疑。



培训费用

10000/人。(包含学费、资料费、实操练习费、测序费、午餐及其他材料费用)
往返路费、住宿费用自理,公司协助安排住宿。

报名方式

1. 扫描二维码报名;
2. 联系当地销售报名;
3. 拨打电话027-62435310报名。


付款方式

户  名:武汉贝纳科技服务有限公司
开户行:汉口银行光谷分行
账  号:005021000159104
 

注意事项

1、自带电脑
2、可在培训期间获取发票。



 




 
贝纳基因Nanopore测序的优势
 
贝纳基因做为国内首批引进Nanopore PromethION 的测序平台,拥有多年的高通量测序,三代测序和 Nanopore 测序,以及生物信息分析经验,在Nature 和 Science 系列杂志发表多篇学术论文。
 



贝纳基因使用Nanopore 平台完成数千份细菌基因组、宏基因组测序和数据分析;完成数千份全长转录组和Direct 转录组测序分析。提出和推动基于Nanopore 测序的万种微生物基因组完成图计划和10万个人的Nanopore 宏基因组计划。
贝纳基因使用 Nanopore 平台完成全球第一个大型复杂植物基因组菊花基因组的组装和后续分析工作。提出和推动千种本草基因组计划,并构建药用植物基因组数据库,推动药材研究的发展。

 
Nanopore测序技术简介

Nanopore是基于纳米孔的单分子实时电信号测序技术。其技术原理是DNA 双链在马达蛋白的带领下与镶嵌在生物膜上的纳米孔蛋白结合并解螺旋,在生物膜两侧电压差的作用下,DNA 双链以一定的速率通过纳米孔通道蛋白,由于DNA 双链上不同碱基化学性质存在差异,所以当单个碱基或DNA 分子通过纳米孔通道时,会引起不同电学信号的变化。通过对这些信号进行检测及对应,即可计算获得相应碱基的类型,完成序列的实时测定。
 




Nanopore测序特点

1)体积小
2)读长长,比 PacBio测序的还要长平均读长能够达到几十到上百 Kb,最长读长能达到2 Mb以上。
3)能直接读取出甲基化的胞嘧啶,不用像二代测序那样需要事先对基因组进行bisulfite处理。
4)数据实时读取,并且起始DNA在测序过程中不被破坏。
5)成本低,比 PacBio 测序便宜。
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