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Nanopore 测序仪全家福


纳米孔测序技术是Oxford Nanopore Technologies(ONT)公司开的测序技术,又被称为第四代测序技术,由于其长度长、便捷、应用场景广泛为市场所熟悉。同时ONT公司也开发了不同仪器以满足不同用户类型的需求。
 

 第一部分:Nanopore测序技术的特点

1. 基于电信号的纳米孔测序原理;
2. 实时测序;
3. 对DNA/RNA/扩增片段直接测序,可读取DNA/RNA的碱基修饰;
4. 读取任意长度的DNA/RNA,从短到超长读长;
5. 测序仪灵活:从便携到台式机都可以拓展;
6. 建库方式:简单、快速和自动化;
7. 应用领域广泛:病毒、细菌、真菌、野外环境样本、动植物等基因组、转录组和表观遗传学研究。
 

第二部分:Nanopore 4款仪器介绍
 
仪器型号 Flongle MinION GridION X5 PromethION 48
纳米孔数(单张芯片) / 2048 5*512 3000*48
一次的测序通量 1张芯片 1张芯片 5张芯片 1-48张芯片
单张芯片的数据产出 0.5-1.8GB 10-25Gb 10-25Gb 40-150Gb
RUN一次最多数据产出参考(GB) 1.8Gb 25Gb 125Gb 7.2Tb
测序时间 0-24h 0-48h 0-48h 0-72h
仪器特点 便携 便携 中通量,价格贵 高通量,价格低
应用场景 携带便捷、快速检测 科研(应用少) 科研应用主流
 


第三部分:3种常用仪器PromethION、MinION、Flongle拓展
 

Flongle
v 用于小型测试或实验的迷你测序仪;
v 一次性、按需、经济高效的测序仪;
v 适用于质量检查、扩增、较小的基因组目标区域或诊断领域;
v MinIT可支持IT/软件需求。




MinION
v 袖珍便携式测序平台;
v 512个纳米孔通道
v 10分钟样品制备;
v 快速高效实时分析;
v 适用于直接DNA或RNA测序;
v MinIT可支持IT/软件需求。

PromethION
v 高通量、高样本数测序平台;
v 模块化:48张芯片,每个芯片有3000个测序通道(总计多达144000个);
v 芯片可以单独运行或同时运行;
v 与MinION工作原理相同,但通量更大。



第四部分:Nanopore应用领域

微生物多样性研究(环境科学)、基因组de novo(动植物、真菌、微生物)研究、个体和群体重测序(基础和临床医学)研究、转录组学研究(基因表达调控)、表观遗传学研究(DNA甲基化修饰)和RNA修饰研究。
更多应用细节请参考Nanopore 官方网站:https://nanoporetech.com/applications




 
第五部分:关于贝纳基因

贝纳基因作为国内首批引进Nanopore测序平台的公司,致力于:提供Nanopore测序技术多场景化应用测序解决方案,现拥有:PromethION48、PromethION 24、MinION、Flongle 等多Nanopore平台,可服务不同领域客户和多种场景需求

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