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环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类新的非编码RNA,在动植物中广泛存在。通过去除rRNA、线性RNA的链特异性建库方法富集circRNA,基于高通量测序,可以获得大量circRNA的信息,通过生物信息分析,预测cirRNA的结构及靶目标。

产品特色


circRNA鉴定


通过circRNA环形剪接的特点,识别鉴定circRNA转录本,并分析circRNA的来源。


circRNA表达分析


circRNA的表达一般具有组织特异性,通过对所有样本中circRNA的表达量估计,可以了解circRNA在样本中的表达模式,分形样本在表达模式上的相关性。




circRNA差异表达分析
 
在处理组和对照组之间,分析差异表达的circRNA,推测差异的circRNA与表型差异的关系。


来源基因的KEGG/GO富集分析

在特定条件下有的基因的转录本会形成circRNA,而不形成mRNA。对差异circRNA的来源基因进行GO/KEGG富集分析,有助于分析差异表型与circRNA的功能。


miRNA与circRNA互作分析

研究发现一些circRNA序列上存在miRNA的结合位置,这些circRNA可以招募miRNA,参与转录调节。

 
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