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原核转录组
 
基因表达、结构和功能研究
 
针对原核生物mRNA进行测序和分析。可用于:
表达分析:计算样本中基因的表达量,鉴定样品间差异表达基因,并进行差异表达基因的COG分类和GO、KEGG功能富集分析;
结构分析:优化已有基因结构、UTR注释,进行操纵子预测、反义转录本预测、启动子motif分析和变异检测等。


 
产品特色


 
测序样品在基因组上的覆盖度差异
 
将测序序列比对到参考基因组上,沿基因组依据覆盖深度绘图。结合基因在染色体上的分布结构,可以直观的反映样品间的差异。


差异表达基因的COG分类

基于所有差异表达基因的COG注释,进行COG分类统计。也可以根据您的需要,对比不同分组间,差异表达基因的COG分类差异。


操纵子结构预测

基于转录组数据,可以预测操纵子的结构。一般功能相近的基因会在一个操纵子里面,帮助您解析基因调控的机制。

启动子motif预测

启动子区域有一些保守的motif,在基因转录调控中起重要的作用。通过启动子motif预测,可以完善基因结构注释,发现新的调控原件。
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